水通量和脫鹽率是描述反滲透膜性能的主要參數，這兩個參數受多種因素的影響，如：進水壓力、溫度、給水含鹽量、pH、流量、回收率等。

 (1)  操作壓力 

     進水壓力本身并不會影響鹽透過量，但是進水壓力升高使得驅動反滲透的凈壓力升高，使得產水量加大，同時鹽透過量幾乎不變，增加的產水量稀釋了透過膜的鹽分，降低了脫鹽率，提高脫鹽率。當進水壓力超過一定值時，由于過高的回收率，加大了濃差極化，又會導致透過量增加，抵消了增加的產水量，使得脫鹽率不再增加。水通量的增加與壓力成正比，在不增加膜面積的情況下，只需增加進水壓力就能獲得較大的水通量，但這樣會造成能量的大量消耗和對膜元件的破壞，脫鹽率與壓力一般也成正比，但隨著膜元件類型的不同，變化趨勢有所差異。

(2)  溫度 

  溫度對脫鹽率和產水量的影響非常大，當溫度升高時，由于水粘度的降低，產水量會隨之增加，進水溫每升高 1℃，產水通量就增加 2.5%~3.0%；其原因在于透過膜的水分子粘度下降、擴散性能增強。進水溫的升高同樣會導致脫鹽率的增加和脫鹽率的下降，這主要是因為鹽分子透過膜的擴散速度會因溫度的提高而加快。溫度對脫鹽率的影響與膜材質有關，一般來講溫度升高脫鹽率降低。針對溫度對膜性能的影響，膜生產商都給出相應的溫度校正系數，用于將系統運行參數標準化。

(3)  給水含鹽量 

     在一定的壓力下，當給水中含鹽量增高時，由于給水滲透壓變高，有效壓力隨之降低，產水量會減少。滲透壓是水中所含鹽粉或有機物濃度的函數，含鹽量越高滲透壓也增加，進水壓力不變的情況下，凈壓力將減小，產水量降低。脫鹽率正比于膜正反兩側鹽濃度差，進水含鹽量越高，濃度差也越大，透鹽率上升，從而導致脫鹽率下降。給水含鹽量對脫鹽率的影響隨膜類型的不同呈現不同的變化規律。

 (4)  進水 pH 值對反滲透膜的影響 

進水 pH 值對產水幾乎沒有影響；而對脫鹽率有較大影響。由于水中溶解的 CO₂在低 pH 值時以氣態 CO₂形式存在，容易透過返反滲透膜，所以 pH 低時脫鹽率也較低，隨 pH 升高，氣態 CO₂轉化為 HCO₃^– 和 CO₃^2- 離子，脫鹽率也逐漸上升，在 pH7.5~8.5間，脫鹽率達到最高。

(5)  回收率 

在壓力一定的情況下，回收率提高，濃水產量減少，濃差極化加重，滲透壓升高，有效壓力降低，最終導致產水量的下降和脫鹽率的降低。如果回收率增加（進水壓力恒定），殘留在原水中的含鹽量更高，自然滲透壓將不斷增加直至與施加的壓力相同，這將抵消進水壓力的推動作用，減慢或停止反滲透過程，是滲透通量降低或甚至停止。正是因為反滲透膜的運行受多種條件因素的影響，探討最佳的運行條件對于反滲透膜元件的正常使用有非常重要的作用，而在實際工程中應結合現場情況，調試各個參數，以保證膜長期的使用壽命。通過對進水施加壓力當濃溶液和稀溶液間的自然滲透流動方向被逆轉時，實現反滲透過程。